Madrasah Aliyah Negeri 1 Karawang pada mulanya bernama Pendidikan Guru Agama Pertama (PGAP) Syarif Hidayatullah yang berdiri pada tanggal 28 Oktober 1965. Kemudian pada tahun 1967 dinegerikan menjadi PGAN 4 tahun berdasarkan KMA. No.118 Tahun 1967.
Pada tahun 1970 PGAN 4 tahun disempurnakan menjadi PGAN 6 tahun berdasarkan KMA nomor 6 Tahun 1970 sesuai dengan perkembangan pendidikan di Indonesia maka berdasarkan surat keputusan Direktorat Jenderal Pembinaan Kelembagaan Agama Islam Nomor : 69/E/1991 tanggal 27 Juli 1991 PGAN 6 Tahun Cilamaya dialih fungsikan menjadi MAN Cilamaya.
Pada tahun 1970 PGAN 4 tahun disempurnakan menjadi PGAN 6 tahun berdasarkan KMA nomor 6 Tahun 1970 sesuai dengan perkembangan pendidikan di Indonesia maka berdasarkan surat keputusan Direktorat Jenderal Pembinaan Kelembagaan Agama Islam Nomor : 69/E/1991 tanggal 27 Juli 1991 PGAN 6 Tahun Cilamaya dialih fungsikan menjadi MAN Cilamaya. Melalui Keputusan Menteri Agama Nomor 212 Tahun 2015 MAN Cilamaya berganti nama menjadi MAN 1 Karawang.
Berikut ini adalah nama-nama kepala sampai sekarang:
- Ma’syum Djauhari, BA (1965 – 1967) Kepala PGAP Cilamaya
- Drs. Sumarno (1967 – 1971) Kepala PGAN 4 tahun
- Drs. Enoch Supiatin (1971 – 1991) Kepala PGAN 6 Tahun
- Drs. Enoch Supiatin (1991 – 1995) Kepala MAN Cilamaya
- H. Ichsanudin, BA (1995 – 1999) Kepala MAN Cilamaya
- Drs. H.A. Nu’man (1999 – 2002) Kepala MAN Cilamaya
- Drs. H. Syarbini (2002 – 2004) Kepala MAN Cilamaya
- Drs. H. Ibrahim, M.Pd.I (2004 – 2010) Kepala MAN Cilamaya
- Budiharjo, M.Pd (2010 – 2011) Kepala MAN Cilamaya
- Drs.H. Ahmad Syarifuddin (2011 – 2014) Kepala MAN Cilamaya
- Drs. H. Kusnawan, M.Pmat (2014 – 2015) Kepala MAN Cilamaya
- Drs. H.Asep Parhan, M.Si (2015 – 2017) Kepala MAN Cilamaya
- H.Sutarna,S.Pd M.MPd (2017 – 2021) Kepala MAN 1 Karawang
- Drs. H. Ilin Nuryadin, M.Pd.I (2021 – s.d sekarang) Kepala MAN 1 Karawang